Основатель общины индепендентов Роберт Броун в 1582 году опубликовал резкий памфлет против англиканской церкви. В сочинении «Об образе жизни истинных христиан» он писал о двух царствах. Царством Антихриста он называл любую церковь, зависевшую от светской власти. Царство Христа – церковь, община, собрание верующих, предающая себя в свободном союзе с Богом, на волю Бога и Христа. Иисус – единственный глава церкви. От него поставляются старейшины, пастыри и помощники. Общиной должна управлять воля самих верующих, воля большинства.
Первые индепенденты, так их стали называть в XVII веке, считали, что всякая, даже совсем маленькая религиозная община должна пользоваться в делах веры безусловной свободой. Не должно быть ни единой национальной церкви, ни всеобщей подати для содержания духовенства, которое должно жить трудом своих рук и добровольными приношениями верующих. Общественные школы должны быть лишены церковного характера. Доступ к государственным должностям не должен обуславливаться принадлежностью к одному определенному вероисповеданию.
В то время в Англии отделение от государственной церкви рассматривалось как преступление против верховной власти. Independents – «независимые» стали подвергаться преследованиям, несколько человек были казнены. Демократическая организация церкви считалась опасной для монархии. Индепенденты эмигрировали в Голландию. Пуритан, не до конца порвавших с англиканской церковью, особенно пресвитериан, с их единообразной по форме и организации церковью, индепенденты называли лицемерами, отбрасывающими комара, но пропускающими верблюда.
В общинах индепендентов каждый имел право пророчества, право свободного слова для поучения общины. Всякая предписанная молитва считалась почти богохульством, отрицанием Духа Святого. Независимые признавали только непосредственные проявления, соответственные внутреннему настроению в данную минуту. Между христианами если и может существовать господство, то не одного над всеми, а только одного вместе со всеми. Это были первые шаги к народному правлению – «знание и ум обнаруживаются в борьбе за истину, благодать же в делах и святой жизни».
В 1616 году из Голландии в Англию вернулся Генри Джекоб, основавший в Лондоне индепендентскую общину. В нее вошли честные и энергичные люди, глубоко верующие, неспособные идти на сделки с совестью. Эти люди быстро стали силой, с которой приходилось считаться.
Индепендентами стали лучшие представители всех слоев английского общества.

Большую роль пуритане сыграли в Северной Америке, создав там английские колонии «Новой Англии». Оплотом «чистых» стал Массачусете, который переселенцы постарались превратить в образцовую «библейскую общину». Первый корабль с английскими пуританами «Майский цветок» в 1620 году отплыл из голландской гавани. Прощаясь с ними, идеолог «чистых» Д. Робинзон произнес напутствующую речь, уложив в ней пуританские принципы: «Именем Бога и его святых апостолов заклинаю вас следовать за мной только до тех пор, пока я сам следую за Иисусом Христом. Господь откроет вам еще новые истины. Я не могу оплакивать положение протестантских церквей, которые, достигнув известного предела, не желают идти далее тех, кто служил только орудием в деле реформации. Лютер и Кальвин были великими светочами в свое время, но и они не проникли вполне в тайны Божественной истины. Если бы они жили в наше время, то несомненно подчинились бы откровению, потому что нельзя полагать, чтобы христианская истина вдруг перестала пробиваться сквозь мрак антихриста и сразу могла явиться полнота христианского света».
В 1609 году среди английских эмигрантов – противников англиканской церкви в Голландии возникла первая община баптистов. В 1612 году многие эмигранты вернулись в Англию, и на Острове в 1633 году появились баптистские общины.
Отличительной особенностью баптизма стало требование сознательного принятия крещения и автономии общин. У баптистов было много различных течений и толков. Общую характеристику баптизма дать практически невозможно, так как возможные толкования Библии безграничны. Baptizo – «крещенцы» не признавали многих церковных догматов и обрядов, они ориентировались только на Библию. Они считали, что являются преемниками первоначального учения апостолов во всей его частоте. Многие из баптистов, выдвинувшихся из среды пуритан, комментировали многие неоднозначные места из Священного Писания, отрицали различия между Ветхим и Новым Заветом.